台商若想繼續享有企業所得稅減按15%徵收，或在經濟特區享有「兩免三減半」的租稅優惠。就需積極獲得「高新技術企業證書」, 認證關鍵即是「專利數量」。

「十二五」規劃，及近期優惠政策，都顯示大陸產業發展重心已移至「高新技術產業」。值得注意的是「高新技術產業」並不完全等同「高科技產業」；即使從事傳統製造業的台商，都應積極爭取高新技術企業認證。

依大陸國稅總局發布「高新技術企業認定管理辦法」，「國家重點支持的高新技術領域」，除電子資訊、生物製藥、航空技術、新能源等領域外，「高新技術改造傳統產業」也併列為高新技術領域。因此，即使從事傳統製造業的台商，也該試圖爭取。

華信國際企管顧問公司總經理袁明仁點出，被認定為「高新技術產業」的關鍵是「專利」的擁有數，大陸的專利是向各地方（省、市、自治區）申請。得到認證的「專利」，最好是具有功能性的「新型專利」，而非普通的「外觀專利」。傳統的製鞋業，也可能因製程改良、營運模式升級而申請相關專利，進而獲得「高新技術產業」的認證資格。

安永聯合會計師事務所周澔宇會計師表示，欲申請高新技術產業的企業，需備妥包括核心技術擁有知識產權證明（專利）、研究開發費用、研發人員占比等文件資料，向各地方的「科學技術委員會」提出申請，經各省級的「稅務機關」查核無誤後，被核准認定為高新技術的企業，將獲頒「高新技術企業證書」。

畢馬威企業諮詢（中國）公司稅務高級經理趙基良發現，實務上已發現公司因「高新技術企業證書」過期失效，面臨補稅的案例；此外，即使證書未過期，但不符合最初申請資格者，即使已獲證書也認證無效。針對以上，大陸財政部近期開始密集抽查。

辦法規定，「高新技術企業證書」有效期僅「三年」，期滿前三個月內，企業應提交近三年研究開發等技術創新活動的報告，提出複審申請，不提出複審申請或複審不合格的，其高新技術企業資格到期自動失效。

此外，已享有「兩免三減半」優惠者，第三年起的過渡期，是依法定企業所得稅25%來減半徵收，而非依高新技術企業的優惠稅率15%來減半徵收。實務上經常出現「優惠疊加」的錯誤，而面臨補稅或裁罰，台商申報時應予以留意。