第六次江陳會將簽署「兩岸醫藥衛生合作」協議，包括兩岸傳染病防治、藥品器材等的安全管理和中醫藥材的管理、檢測，而最受矚目的兩岸共同以符合國際規格的新藥和臨床認證，並未入列，生醫業者認為：落差太大，未來業者還要「自謀出路」。

中天董事長路孔明表示，新藥和臨床未能共同認證，將讓業者在大陸的拓展計畫時程受限，但因認證問題原本就未存在，只是在「原點踏步」，因此，對生技業者的衝擊不大。

由於新藥認證是一個國家的主權，全世界沒有任何國家採用相互認證，生策會執行長吳明發認為，第六次江陳會針對藥品認證，雖然沒列入，但相關單位仍會努力希望爭取以美國FDA標準為基準，在臨床項目、審核的時間流程都能簡化，讓國內的新藥能用最快速的時間打進大陸市場，降低廠商資金投入的風險。

不過，由於生醫業者原本就積極布建大陸市場，像東洋鎖定心血管和癌症用藥，中天也以保健食品進入，聯合骨科、太醫、必翔等醫材廠亦積極卡位，佳醫也與國藥集團合資在大陸布建洗腎事業，加上在大陸市場已開始收成的蘇州中化和永信等，生醫業者認為，生技公司會「自謀出路」，還是有機會脫穎而出。