臺北醫學大學由「產學育成營運中心」負責推動產學合作，績效卓著深獲企業與政府的肯定。

為充分發揮北醫大在生醫器材領域的專業，使第二棒前後各個產業價值鏈得以緊密有效地串連起來，積極建立策略聯盟，與財團法人塑膠工業技術發展中心、金屬中心、國研院儀科中心等組成研發合作聯盟。

為創新產品提升競爭力，使醫療產品國產化，並通過於高雄科學園區設立南科創新研發中心的計畫申請，將於99年第三季設立「臺北醫學大學產學育成營運中心南科分部」，提供生技製藥暨醫材產業發展階段所需的法務、智權、技術及營運等各類服務與協助，提升我國生醫產業競爭力、擴大醫療產業產值比重，提供中小型傳統製造產業技術與價值升級及新創公司研發技術提升的契機為目標。

邱文達校長表示，北醫大積極推動產、官、學、研、醫的整合，在歐耿良教授人工牙根產業加值平台的策略輔導下，99年7月鴻君科技與北醫大合作開發的人工牙根獲衛生署查驗登記通過，成為第一個台灣自產的人工牙根品牌，將搶佔台灣每年20萬顆人工植牙的市場，並著手拓展年產值31億美元的全球人工牙根市場。

北醫大輔導企業開發關鍵產品製程與創新核心技術，整合相關進駐廠商進行業界合作，以技術平台、產品設計、行銷通路、落實跨國產業聯盟策略，積極推動歐洲廠商百丹特（Biodenta）與醫橋及鴻君科技的聯盟合作關係，落實臨床設計及加工製造的整合，以達上中下游合作，促進產業的發展，提昇台灣自有品牌產品的商業化績效，使人工牙根品牌得以在台灣深根及拓展；未來將授權給國內外藥廠或策略聯盟，推動台灣產品的國際化。

配合政府南科醫療器材聚落的政策，北醫大將生技醫療的研究與臨床專業由北台灣擴展到南台灣，輔導京達科技以開發「自有品牌與技術的針灸針」、全球安聯科技以「微創器械開發研究」為定位，更促成屴誠科技和歐洲廠商百丹特結盟研發「奈米氧化鋯及醫用合金」。北醫大結合學校與附屬醫院－北醫附醫、萬芳醫學中心及雙和醫院於臨床與基礎研究能量，於生技醫療領域創造產業利基，提升台灣自有品牌產品的商業化績效。