生策會表示，兩岸醫藥衛生合作協議12月21日完成簽署，這是雙方會談以來，首次針對維護民眾健康以及生醫產業發展明確訂出合作協議，對於兩岸業界開拓全球經濟市場，極為重要。

生策會表示，作為民間整合資源平台，努力催生兩岸合作協議，連續八年舉辦「華人健康平臺」，逐步凝聚兩岸合作共識。

2009年五月即向時任行政院劉兆玄提出建言，呼籲在兩岸會談中納入「合作推動新藥臨床試驗暨建立相互承認機制」，同年九月創辦人王金平院長，親自授旗會長陳維昭，帶領八人小組，到北京參訪，與中國衛生部、藥監局與中醫藥管理局等官員會面，而此行達成六項合作共識，促使醫藥衛生議題得以正式納入第六次江陳會談。

生策會多年努力，籲請建立兩岸合作機制得到初步的成果。對此，生策會除了欣慰，也感謝各界專家的支持與協助。

生策會綜合產學研界對於協議的內容、未來發展方向發表以下聲明：

一，生策會對於兩岸醫藥衛生合作協議順利完成簽署表達高度肯定。

二，兩岸醫藥衛生合作協議中，針對「藥品管理規範」、「臨床試驗合作」皆採用國際認可標準，生策會對此表示肯定，希望未來兩岸生醫合作，也能延續這樣的模式，採取國際標準，推動彼此交流合作，並限定新藥審查時程，以免造成時間、成本浪費。

三，兩岸醫藥衛生合作協議中，針對疾病防治，僅討論傳染病一項，未來建議納入華人好發疾病，譬如癌症、肝病、肺結核、慢性腎臟病等進行研究交流，解決華人共通特有疾病，提升兩岸人民健康。

四，協議之成敗與否在於是否落實。在此籲請相關單位務必在協議生效三個月內，提出各工作組具體合作規劃及執行細項，公告周知。

五，「兩岸醫藥衛生合作協議」對於兩岸人民健康、產業發展相當重要，生策會長期推動兩岸健康平台工作且為研產學重要平台，將持續關注、協助執行此協議之後續進度與成果。