製藥業長期享租稅優惠，近年轉型朝異業垂直聯盟與多元化經營，面臨許多新稅務議題。資誠會計師事務所會計師廖烈龍昨（7）日表示，製藥業有效稅率增加是趨勢，業者須妥善稅務規劃，透過簽訂政府間租稅協定並與企業參與者協商，才能降低稅務風險，將利潤極大化。

廖烈龍指出，無論是外國集團投資的台灣業者，或是台灣本土製藥業者，都應注意可能面臨固定營業場所認定引起的雙重課稅、集團利潤分配移轉訂價等稅務議題。

廖烈龍說，目前製藥業發展有兩個趨勢，一是垂直整合聯盟，與學術單位、醫院、運動中心等組織合作，提供多樣化服務，例如物理治療、健康篩檢等；第二轉型為多元化企業集團，提供醫療服務。

廖烈龍表示，提供醫療服務可能會拉高企業有效稅率，因服務業只能在本地提供，不像製造業可到低薪資國家生產，企業很難像以往將高稅率地區的利潤移轉到低稅率地區。

國外藥廠來台創設醫療服務，很難證明在台灣沒有固定營業場所，提供服務將增加扣繳義務，跨國企業會發現已繳的外國所得稅很難扣抵國內所得稅，可能有雙重課稅的風險。

廖烈龍指出，製藥業者持續開展新興市場，各種跨境交易會大增，如何制定移轉訂價報告，並依不同合作者的貢獻分配利潤，將是一項大任務。

資誠會計師事務所協理胡緒之說，製藥業與其他產業垂直合作，會讓課徵間接稅變得複雜，因為醫療保健服務包含商品與服務，兩者稅率不同。

胡緒之指出，例如政府將醫療保健認定為服務而課以較高稅率，病患將付高價才能買到醫療保健服務；若視為免稅醫療服務，則供應商將無法回收其進項增值稅。

胡緒之表示，製藥業發展醫療服務供應鏈管理，涉及多個異業或多個國家時，須彼此簽定合約以減少進口稅負，並進行供應鏈的整體稅務規劃。