為保障海峽兩岸人民權益，促進兩岸經濟、科技與文化發展，財團法人海峽交流基金會與海峽兩岸關係協會就兩岸智慧財產權（知識產權）保護合作事宜，經平等協商，達成協議如下：

一、合作目標雙方同意本著平等互惠原則，加強專利、商標、著作權及植物品種權（植物新品種權）（以下簡稱品種權）等兩岸智慧財產權（知識產權）保護方面的交流與合作，協商解決相關問題，提升兩岸智慧財產權（知識產權）的創新、應用、管理及保護。

二、優先權利雙方同意依各自規定，確認對方專利、商標及品種權第一次申請日的效力，並積極推動做出相應安排，保障兩岸人民的優先權權益。

三、保護品種雙方同意在各自公告的植物種類（植物品種保護名錄）範圍內受理對方品種權的申請，並就擴大可申請品種權之植物種類（植物品種保護名錄）進行協商。

四、審查合作雙方同意推動相互利用專利檢索與審查結果、品種權審查和測試等合作及協商。

五、業界合作雙方同意促進兩岸專利、商標等業界合作，提供有效、便捷服務。

六、認證服務雙方同意為促進兩岸著作權貿易，建立著作權認證合作機制，於一方影音（音像）製品於他方出版時，得由一方指定之相關協會或團體辦理著作權認證，並就建立圖書、電腦程式（軟件）等其他作品、製品認證制度交換意見。

七、協處機制雙方同意建立執法協處機制，依各自規定妥善處理下列智慧財產權（知識產權）保護事宜：（一） 打擊盜版及仿冒，特別是查處經由網路（網絡）提供或幫助提供盜版圖書、影音（音像）及電腦程式（軟件）等侵權網站，以及在市場流通的盜版及仿冒品；（二） 保護著名（馳名）商標、地理標誌或著名產地名稱，共同防止惡意搶註行為，並保障權利人行使申請撤銷被搶註著名（馳名）商標、地理標誌或著名產地名稱的權利；（三） 強化水果及其他農產品虛偽產地標示（識）之市場監管及查處措施；（四） 其他智慧財產權（知識產權）保護事宜。在處理上述權益保護事宜時，雙方可相互提供必要的資訊，並通報處理結果。

八、業務交流雙方同意開展智慧財產權（知識產權）業務交流與合作事項如下：（一） 推動業務主管部門人員進行工作會晤、考察參訪、經驗和技術交流、舉辦研討會等，開展相關業務培訓；（二） 交換制度規範、資料庫（數據文獻資料）及其他相關資訊；（三） 推動相關文件電子交換合作；（四） 促進著作權集體管理組織交流與合作；（五） 加強對相關企業、代理人及公眾的宣導；（六） 雙方同意之其他合作事項。

九、工作規劃雙方同意分別設置專利、商標、著作權及品種權等工作組，負責商定具體工作規劃及方案。

十、保密義務雙方同意對於在執行本協議相關活動中所獲資訊予以保密。但依請求目的使用者，不在此限。

十一、限制用途雙方同意僅依請求目的使用對方提供之資料。但雙方另有約定者，不在此限。

十二、文書格式雙方同意交換、通報、查詢資訊及日常業務聯繫等，使用商定的文書格式。

 十三、聯繫主體本協議議定事項，由雙方業務主管部門指定的聯絡人相互聯繫實施。必要時，經雙方同意得指定其他單位進行聯繫。本協議其他相關事宜，由財團法人海峽交流基金會與海峽兩岸關係協會聯繫。

十四、協議履行與變更雙方應遵守協議。本協議變更，應經雙方協商同意，並以書面形式確認。

十五、爭議解決因適用本協議所生爭議，雙方應儘速協商解決。

十六、未盡事宜本協議如有未盡事宜，雙方得以適當方式另行商定。

十七、簽署生效本協議簽署後，雙方應各自完成相關程序並以書面通知對方。本協議自雙方均收到對方通知後次日起生效。