民眾常使用的紅棗、當歸等中藥材，從9月15日起進口都要附上檢驗證明。衛生署中醫藥委員會主委黃林煌表示，針對10種中藥材，包含當歸、甘草、紅棗、黃耆、地黃、川芎、杜仲、白朮、白芍、茯苓，進口時必須附上重金屬、黃麴毒素、農藥殘留等的書面檢驗證明。
其中每年占8,000公噸進口量的紅棗、黃耆、當歸、甘草，除了證明外，入關前還得抽驗5％；該措施將使台灣民眾對中藥的使用習慣產生根本的改變，中藥材也跟中藥製劑一樣會有自己的生產履歷與品質標準。
黃林煌指出，台灣長期以來市面上販售的中藥材，有90％來自中國，但多年來不審不驗，讓台灣被冠上不良藥材的最大輸入國，為了保障全民用藥安全，藥材管理實在刻不容緩！9月中旬實施邊境管制的藥材是從中國進口的中藥材裡面選出，最常進口的前10項，使用率已經占了市場的50％。其中，進口檢驗證明可由台灣GMP藥廠、通過政府標準合格實驗室及中國大陸質檢機構出示。
中華民國中藥商業同業公會全國聯合會表示，針對9月將實施的邊境管制，該會對於目前大陸出具的報告是否具有國際公信力存疑，因此在大陸質檢機構提供檢驗證明書的部份，持反對立場。另外在抽批查驗上，公會也強調在未建立完整具體配套措施時，先暫緩實施，公會絕對支持建立中藥材管理，建議在國內建立良好的檢驗機制，並由公會配合自律自主管理，以達務實有效。
國內大型中藥廠勝昌製藥總經理李威著表示，站在藥廠的立場，台灣的藥廠皆具備完善的藥材檢驗能力，具有優質的檢驗人才與完整的檢驗設備，甚至很多藥廠的品管實驗室均已通過TFDA藥物化妝品實驗室認證或是TAF（ISO17025）認證程序，未來將配合政府政策，協助業者檢驗。
此外，為避免檢驗資源重複浪費，李威著建議藥廠輸入自用原料藥材之邊境管理方法，應與貿易用之輸入中藥材管理模式有所區別。
李威著表示，衛生署中醫藥委員會應該同意中藥GMP廠申請輸入之自用原料，得以在入境後先領貨運至藥廠的倉庫暫存待驗，由藥廠依公告要求，完成污穢物質檢查後，檢具檢驗報告書限期向各區承辦輸入申請之辦公室核備；對於檢驗不合格的藥材，則依GMP規定進行退貨或銷毀。而對紅棗、黃耆、當歸、甘草等4種藥材另外抽檢；因為根據GMP之原料管理要求，已經足以嚴格管控其品質，再加上衛生主管機關對中藥產品的嚴格監控，實在沒有必要重複檢驗，浪費資源。